Канадские исследователи определяют мутации, связанные с редкой формой рака печени

Однако если в Северной Америке она ежегодно поражает лишь приблизительно одного из 100 000 жителей, то в Таиланде ежегодно наблюдается порядка 96 случаев заболевания на 100 000 человек. Прогноз для пациентов, пораженных внутрипеченочной холангиокарциномой, неутешительный, поскольку опухоли на ранней стадии обычно не обнаруживаются из-за того, что они скрыты в желчных протоках, локализованных глубоко внутри организма. Таким образом, рак диагностируется только после появления симптомов и начала развития болезни. Эффективных методов лечения внутрипеченочной холангиокарциномы на данный момент не существует, и средняя продолжительность выживания после постановки диагноза составляет лишь 6-9 месяцев.

Исследователи из Университета Саймона Фрейзера (Бёрнаби, провинция Британская Колумбия, Канада) секвенировали ДНК опухоли и подобрали пары контрольных образцов из большой группы, включавшей 103 пациентов из Китая, больных внутрипеченочной холангиокарциномой, в результате чего была определена соматическая мутационная сигнатура, специфичная для внутрипеченочной холангиокарциномы, которая была связана с воспалением печени, фиброзом и циррозом печени.

В дальнейшем были обнаружены 25 значительно мутировавших генов, включая 8 потенциальных генов-драйверов (TP53, KRAS, IDH1, PTEN, ARID1A, EPPK1, ECE2 и FYN). В каскаде реакций (Ras/передача сигналов фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат 3 киназы, p53/ передача сигналов клеточного цикла и трансформирующий ростовой фактор бета 1/передача сигналов Smad) задействованы гены, играющие важную роль в эпигенетическом регулировании и окислительном фосфорилировании, но при внутрипеченочной холангиокарциноме, как было определено, данные механизмы оказались существенно поражены.

“Наше исследование – вне всяких сомнений самая всесторонняя работа по определению последовательности аминокислотных остатков в белках для обнаружения мутаций, связанных с внутрипеченочной холангиокарциномой. Исследование станет важным ресурсом для ученых, стремящихся лучше понять особенности возникновения заболевания и его лечения, — сказал соавтор, доктор Наньшэн Чэнь (Nansheng Chen), преподаватель молекулярной биологии и биохимии в Университете Саймона Фрейзера. — Некоторые типы рака, включая внутрипеченочную холангиокарциному, являются малораспространенными в Канаде, где население относительно малочисленное, а разнообразие этнических происхождений большое. Для понимания процесса формирования опухолей при этих редких типах рака мы должны организовывать совместные проекты, как наш, чтобы получить доступ к большим группам образцов. Результаты этого исследования помогут лучше узнать о мутациях-драйверах у китайских канадцев, страдающих раком внутрипеченочных желчных протоков. Наше исследование иллюстрирует реальные возможности и создает модель для работы над предпосылками редкого заболевания".

Исследование было опубликовано 15 декабря 2014 года в интернет-версии журнала Nature Communications.

Ссылки по теме:
Simon Fraser University