Сравнение экспресс-методов для положительных гемокультур

Разработано несколько методов для идентификации болезнетворных микроорганизмов и найдено некоторое количество генов устойчивости к антибиотикам, полученные непосредственно из колб с положительной гемокультурой, что может сократить время выполнения заключительного определения и чувствительности на один-два дня.

В промежутке между октябрем 2012 и маем 2013 гг. ученые медицинской лаборатории Университета Флориды (Гейнсвилль, штат Флорида, США) непосредственно сравнили метод сложной полимеразной цепной реакции (ПЦР) с масс-спектрометрическим комплексом для идентификации организмов в положительных гемокультурах. Они проанализировали жидкую среду 161-ой положительной гемокультуры обоими методами в течение 2-12 часов с момента получения положительного сигнала в колбах BacTec plus aerobic/F, выдержанных в приборе BacTec 9240 (Becton, Dickinson and Company; Франклин Лэйкс, штат Нью-Джерси, США).

Среди двух методов, используемых для идентификации бактерий, был прибор FilmArray, непосредственно предназначенный для определения системы положительной гемокультуры (компания BioFire Diagnostics, Солт-Лейк-Сити, штат Юта, США), и масс-спектрометрический комплекс VITEK (компания bioMérieux; Дарем, штат Северная Каролина, США). Метод определения положительной гемокультуры использует сложную ПЦР для идентификации от 90-95% простых культур до совокупности классов или видов, а также трех генов устойчивости к антибиотикам, выдавая результат приблизительно через один час. Обработка подготовленных препаратов для системы Vitek MS выполнялась в масс-спектрометре производства компании bioMérieux (Марси-л'Этуаль, Франция).

В общей сложности 132 из 133 (99%) культур, которые прошли через FilmArray, были правильно идентифицированы по классам и/или видам. Для тех микроорганизмов, которые аппарат FilmArray мог определить к видам или совокупностям видов, 84 из 84 (100%) были правильно идентифицированы; для тех, которые только ожидалось определить на уровне класса, 48 из 49 (98%) были выявлены правильно. Длительность выполнения цикла для отдельного теста FilmArray составляет приблизительно час и, если нужно запускать выполнение анализа множества образцов, могут понадобиться комплексные инструменты.

Методом масс-спектрометрии было правильно идентифицировано 142 из 151 (94%) мономикробных культур на уровне класса и 137 из 151 (91%) на уровне вида. Vitek MS может обработать до 48 образцов одного препарата и дать готовый результат приблизительно через час, но фактическое время на выполнение прямого определения положительной гемокультуры из колбы будет зависеть и от времени фильтрации и от настроек технологического процесса, чтобы установить препарат и произвести считывание в масс-спектрометре.

Авторы пришли к заключению, что и аппарат FilmArray, и системы масс-спектрометрии VITEK MS продемонстрировали высокую степень точности и могут обеспечить получение результатов приблизительно через час после того, как гемокультуры становятся положительными, однако FilmArray намного легче в эксплуатации и его проще внедрить в лабораторный технологический процесс. Исследование было опубликовано 22 марта 2014 года в онлайн-версии журнала Diagnostic Microbiology and Infectious Disease.

Ссылки по теме:
University of Florida
Becton, Dickinson and Company
BioFire Diagnostics