Генетическое тестирование идентифицирует подтип высокого риска острого лимфобластного лейкоза

Взрослые составляют около 40% от предполагаемых 6,590 новых случаев ОЛЛ, выявляемых в США ежегодно.

Подтип острого лимфобластного лейкоза высокого риска, впервые выявленный у детей, широко распространен у взрослых с ОЛЛ и ассоциируется с неблагоприятным исходом, но пострадавшие пациенты могут получить пользу от лечения имеющимися препаратами.

Большая группа ученых в сотрудничестве со своими коллегами из Детской исследовательской больницы Св. Иуды (St. Jude Children's Research Hospital; Мемфис, штат Теннесси, США) изучили лейкозные образцы материала из биобанка, полученные при постановке диагноза от 909 пациентов с B-клеткой-предшественником ОЛЛ (В-ОЛЛ), в 798 из которых содержался подходящий материал для геномного анализа. Когорта была разделена на следующие три возрастные группы: 344 молодых человека возрастом от 21 до 39 лет, 304 взрослых в возрасте от 40 до 59 лет и 150 пожилых людей в возрасте от 60 до 86 лет.

Анализ уровня экспрессии генов проводили на 798 образцах рибонуклеиновой кислоты (РНК) с использованием либо микрочипов U133 Plus 2.0, либо 15-генного массива низкой плотности (low-density array - LDA) методом количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР) с обратной транскриптазой Taqman, который идентифицирует генную сигнатуру осложненного филадельфийской хромосомой (Ph) ОЛЛ, P2RY8-CRLF2, BCR-ABL1, ETV6-ABL1, Tcf3-Pbx1 и DUX4/ERG-дерегулированные ОЛЛ. Транскриптомное секвенирование (RNA-seq) проводили с использованием библиотеки препаратов TruSeq на платформе HiSeq 2000.

Ученые обнаружили, что 194 больных, почти 25%, имели подтип ОЛЛ высокого риска, осложненный филадельфийской хромосомой (Ph-ОЛЛ). На таких пациентов с Ph-ОЛЛ приходилось более 20% взрослых с ОЛЛ, в том числе 27,9% молодых людей, 20,4% взрослых и 24,0% пожилых людей. В целом пациенты с Ph-ОЛЛ имели худшую безрецидивную выживаемость через 5 лет по сравнению с пациентами с неосложненным филадельфийской хромосомой ОЛЛ. Были выявлены одиннадцать новых перестроек киназ, в том числе четыре с участием новых генов рецептора к киназе или цитокинам и семь с участием новых партнеров для ранее выявленных генов. Многие пациенты имели генетические изменения, которые, как предполагается, могут быть излечимы с помощью направленных препаратов, известных как ингибиторы тирозинкиназы, которые уже широко используются для лечения других типов лейкемии, являющихся общими у взрослых.

Первый автор исследования, доктор философии Кэтрин Робертс (Kathryn Roberts), заявила: "Наше комплексное секвенирование показало, что Ph-ОЛЛ у взрослых является наиболее генетически разнообразным подтипом лейкемии, который был описан. Кумулятивно были идентифицированы более 50 различных хромосомных перестроек с участием 15 различных рецепторов киназ и цитокинов. В данном исследовании мы идентифицировали 11 хромосомных перестроек, которые являются новыми для Ph-ОЛЛ". Исследование было опубликовано в ноябре 2016 года в “Журнале клинической онкологии” (Journal of Clinical Oncology).

Ссылки по теме:
Детская исследовательская больница Св. Иуды