We use cookies to understand how you use our site and to improve your experience. This includes personalizing content and advertising. To learn more, click here. By continuing to use our site, you accept our use of cookies. Cookie Policy.

Features Partner Sites Information LinkXpress
Sign In
Advertise with Us
Abbott Diagnostics

Download Mobile App




Разработан низкозатратный метод диагностики с использованием наноструктур

By LabMedica International staff writers
Posted on 29 Oct 2018
Print article
enVision: результаты тестирования обозначаются изменением цвета и могут быть дополнительно проанализированы с помощью приложения для смартфона, что делает его привлекательным в качестве портативного диагностического устройства (фото любезно предоставлено Национальным университетом Сингапура).
enVision: результаты тестирования обозначаются изменением цвета и могут быть дополнительно проанализированы с помощью приложения для смартфона, что делает его привлекательным в качестве портативного диагностического устройства (фото любезно предоставлено Национальным университетом Сингапура).
Обнаружение нуклеиновых кислот возбудителей имеет широкое применение в диагностике и лечении инфекций. Тестирование на вирус папилломы человека (ВПЧ), основанное на нуклеиновых кислотах, имеет большое значение для современной диагностики рака шейки матки. ВПЧ, наиболее распространенная инфекция, передающаяся половым путем, является основной причиной рака шейки матки.

Разработана платформа для экспресс-обнаружения патогенов, в которой используется микроструйная техника, содержащая интегральные схемы ДНК-наноструктур. Показано, что система, получившая название фермент-ассистированные нанокомплексы для визуальной идентификации нуклеиновых кислот, или enVision, способна к молекулярному типированию при комнатной температуре ВПЧ из образцов шейки матки, а также к обнаружению определенных инфекций, которые не могут быть выявлены большинством стандартных методов.

Ученые из Национального университета Сингапура (National University of Singapore; Сингапур) разработали ДНК-ферментные наноструктуры, которые представляют собой комплексы из инактивирующих аптамеров, связанных с ДНК-полимеразой Taq. Когда комплементарная ДНК-мишень связывается с аптамером, полимераза высвобождается. Затем высвобожденные полимеразы используют биотинилированные дезоксирибонуклеотидтрифосфаты (дНТФ), циркулирующие в микроструйной кассете, для удлинения соседней сигнальной наноструктуры, созданной из самовсасывающей шпилечной молекулы.

Биотинилированные дНТФ в сигнальной структуре будут также связывать молекулы стрептавидин-пероксидазы хрена (СПХ) в реакционной камере, а в присутствии диаминобензидинпероксидазы СПХ продуцирует коричневый осадок, который можно увидеть невооруженным глазом или определить количество с помощью смартфона. Система также является модульной. Реакции обнаружения происходят в независимой микроструйной аналитической кассете, в которую предварительно загружены наноструктуры. Для проведения анализа тестовая кассета устанавливается в отдельный модуль картриджа, который является одинаковым для всех тестов и содержит мембраны со встроенными универсальными сигнальными наноструктурами.

Тест enVision также проводился на основе набора из 35 клинических эндоцервикальных образцов в исследовании и сравнивался с золотым стандартом - анализом на ВПЧ Roche Cobas, основанным на количественной полимеразной цепной реакции (кПЦР). Авторы создали enVision для обнаружения локусов ВПЧ типов 16 и 18 L1 в геноме пациента, которые являются объектами теста Roche. EnVision достигла 93%-ной чувствительности и 91%-ной специфичности для ВПЧ-16, а для ВПЧ-18 анализ показал 83%-ную чувствительность и 100%-ную специфичность по сравнению с анализом Cobas. Примечательно, что этот уровень чувствительности и специфичности для клинических образцов был замечен в анализе без предварительной амплификации и оборудования, проводимом при комнатной температуре.

По сравнению с кПЦР, enVision показала лучшую чувствительность и меньшее количество ложноположительных результатов на наборе синтетических мишеней, представляющих различные подтипы ВПЧ. Команда подчеркнула, что кПЦР может быть склонна к ложным срабатываниям из-за неспецифической амплификации и формирования праймерных димеров, которые в клинических условиях могут приводить к неверным диагнозам, неправильному или отложенному лечению, а также тревоге пациентов и их негативным медицинским исходам. Команда также сравнила enVision с тестом на основе изотермической амплификации с формированием петель (loop-mediated isothermal amplification - LAMP) и заметила, что LAMP склонна к образованию праймеров-димеров и ложноположительных результатов. Исследование было опубликовано онлайн 13 августа 2018 года в журнале Nature Communications.

Ссылки по теме:
Национальный университет Сингапура


Print article

Channels

Molecular Diagnostics

view channel
Image: The NovaSeq 6000 Sequencing System offers high-throughput sequencing across a broad range of applications (Photo courtesy of Illumina).

Somatic Evolution Identified in Non-Neoplastic IBD-Affected Colon

Inflammatory bowel disease (IBD) is a debilitating disease characterized by repeated flares of intestinal inflammation. The two major subtypes of IBD, Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC) are... Read more

Industry News

view channel
Image: ChemWell RPR Analyzer (Photo courtesy of Awareness Technology, Inc.)

Awareness Technology Announces ChemWell RPR Analyzer - The Most Significant Innovation in Syphilis Testing in Last 30 Years

Awareness Technology, Inc. (Palm City, FL, USA) has announced the most significant innovation in syphilis testing in the last 30 years with the launch of the ChemWell RPR automated nontreponemal analyzer... Read more
Copyright © 2000-2020 Globetech Media. All rights reserved.