We use cookies to understand how you use our site and to improve your experience. This includes personalizing content and advertising. To learn more, click here. By continuing to use our site, you accept our use of cookies. Cookie Policy.

Features Partner Sites Information LinkXpress hp
Sign In
Advertise with Us
PURITAN MEDICAL

Download Mobile App




Технология Sequins представлена в качестве нового внутреннего контроля для улучшения геномного анализа

By LabMedica International staff writers
Posted on 08 Sep 2016
Исследователи разработали интуитивно понятную технологию под названием “Sequins” - искусственные “зеркальные” последовательности ДНК, которые отражают геном человека и могут использоваться для составления генетических карт, ориентирования и анализа сложности генома. More...
В настоящее время технология геномного анализа человека Sequins широко доступна для исследований.

Ученые из Института медицинских исследований Гарвана (Дарлингхёрст, Сидней, штат Новый Южный Уэльс, Австралия) разработали новую технологию. “Секвенирование генома человека преобразовывает биомедицинские исследования и влияет на оказание медицинских услуг, — сказал доктор Тим Мерсер (Tim Mercer), который руководил разработкой Sequins. — И поскольку секвенирование генома все больше и больше используется, чтобы диагностировать заболевание, становится более важным, чем когда либо прежде, чтобы исследователи и врачи-клиницисты понимали точность геномных данных, которые они проверяют”.

Доктор Мерсер и его команда предложили добавлять sequins, маленькие фрагменты искусственной ДНК, к образцу ДНК пациента во время секвенирования. Эти sequins-фрагменты в дальнейшем выполняют функцию внутренних стандартов, помогая исследователям анализировать большие наборы данных, сформированные во время секвенирования генома. Технология основана на интуитивно простом принципе: на определении зеркальных отображений ДНК. “Sequins по существу являются «зеркальными» отображениями естественных последовательностей ДНК. Также, как и мы, геном имеет хиральность, и так же, как наша правая рука отличается от нашей левой руки, sequins-фрагменты отличаются от естественных последовательностей генома. Таким образом, sequins-фрагменты ведут себя точно так же, как естественные последовательности генома, но они могут быть легко узнаваемы как искусственные”, - сказал доктор Мерсер.

При добавлении к реакции секвенирования sequins-фрагменты осуществляют внутренний контроль, с помощью которого можно оценить чувствительность и точность секвенирования генома. “Целый ряд действий, сначала в лаборатории и затем на компьютере, требуется, чтобы выполнить секвенирование генома человека или генов, которые экспрессированы в различных клетках. Sequins-фрагменты находятся вместе с ДНК человека на каждом этапе: реагируя так же, как настоящая ДНК на каждом этапе, они все же безошибочно отличаются от той настоящей ДНК. Это позволяет ученому оценивать и оптимизировать эти различные этапы”.

Поскольку sequins-фрагменты добавлены к каждому отдельному образцу, они могут обеспечить оценку образца за образцом – того, что ранее не было возможно. “Sequins является первой технологией, которая позволит применять статистическое прогнозирование к каждому отдельному секвенированию генома, — сказал доктор Мерсер. — И мы ожидаем, что их использование улучшит надежность и чувствительность диагностики генетических заболеваний”.

Диагностика рака – это одна из областей, в которой использование Sequins должно привести к улучшениям. «Внедрение технологии Sequins в клинические тесты для диагностики рака повысит надежность вывода отдельных диагностических данных, уменьшая число ошибочных диагнозов и придавая врачам-клиницистам большую уверенность в выборе лучшего курса лечения для их пациента”, - сказал доктор Мерсер.

Использование Sequins также позволит напрямую сравнивать геномные данные, полученные от научно-исследовательских институтов и центров, выполняющих секвенирование, во всем мире. “Технология Sequins вводит секвенирование ДНК в качестве стандарта, применяемого в клиниках, и станет неотъемлемой платформой для геномного исследования и медицины, — сказал соавтор Джон Мэттик (John Mattick), профессор, исполнительный директор Института медицинских исследований Гарвана. — Это еще один важный шаг в продвижении миссии Института медицинских исследований Гарвана по введению использования методов геномики в клинике”.

Возможные области применения технологии Sequins многочисленны. Поскольку все геномы, от геномов бактерий до генома человека, имеют хиральность, sequins могут быть также разработаны для любого организма или любого направления практического применения секвенирования нового поколения.

Технология Sequins описана в двух взаимосвязанных исследованиях, проведенных Хардвиком С.А. (Hardwick S.A.) и соавторами и Девесоном И.В. (Deveson I.W.) и соавторами, оба были опубликованы 8 августа 2016 года в журнале Nature Methods.


Ссылки по теме:
Garvan Institute of Medical Research


New
Gold Member
Blood Gas Analyzer
Stat Profile pHOx
3-Part Differential Hematology Analyzer
Swelab Alfa Plus Sampler
New
Automated Microscope
dIFine
New
Celiac Disease Test
Anti-Gliadin IgG ELISA
Read the full article by registering today, it's FREE! It's Free!
Register now for FREE to LabMedica.com and get access to news and events that shape the world of Clinical Laboratory Medicine.
  • Free digital version edition of LabMedica International sent by email on regular basis
  • Free print version of LabMedica International magazine (available only outside USA and Canada).
  • Free and unlimited access to back issues of LabMedica International in digital format
  • Free LabMedica International Newsletter sent every week containing the latest news
  • Free breaking news sent via email
  • Free access to Events Calendar
  • Free access to LinkXpress new product services
  • REGISTRATION IS FREE AND EASY!
Click here to Register








DIASOURCE (A Biovendor Company)

Channels

Hematology

view channel
Image: CitoCBC is the world first cartridge-based CBC to be granted CLIA Waived status by FDA (Photo courtesy of CytoChip)

Disposable Cartridge-Based Test Delivers Rapid and Accurate CBC Results

Complete Blood Count (CBC) is one of the most commonly ordered lab tests, crucial for diagnosing diseases, monitoring therapies, and conducting routine health screenings. However, more than 90% of physician... Read more

Immunology

view channel
Image: A simple blood test could replace surgical biopsies for early detecion of heart transplant rejection (Photo courtesy of Shutterstock)

Blood Test Detects Organ Rejection in Heart Transplant Patients

Following a heart transplant, patients are required to undergo surgical biopsies so that physicians can assess the possibility of organ rejection. Rejection happens when the recipient’s immune system identifies... Read more
Copyright © 2000-2025 Globetech Media. All rights reserved.