Новый анализ мочи предсказывает высокий риск рака шейки матки

Результаты были проверены на проспективно исследовавшейся группе из 107 женщин, проходивших обследование в клинике по оценке высокого риска в Пуэрто-Рико с 2013 по 2015 гг. Исследователи выявили три гена, связанных с раком шейки матки или атипично выглядящими клетками, которые впоследствии становятся злокачественными: FK506-связывающий белок 6 (FKBP6), Integrator Complex Subunit 1 (INTS1) и белок “цинковый палец 516” (ZNF516). По мере прогрессирования аномалии эти гены были более склонны иметь химические метильные группы, присоединенные к их ДНК в определенных местах.

Образцами были полимеразные цепные реакции, амплифицированные с использованием специфических для образцов индексных праймеров для мультиплексного секвенирования на системе MiSeq (Illumina, Сан-Диего, штат Калифорния, США). С использованием метилирования в качестве оценки для диагностики злокачественной опухоли три гена вместе показали чувствительность 90%, а это означает, что их присутствие было в состоянии предсказать истинную положительную пробу на рак за то же время, и тест имел специфичность 88,9%. Для дальнейшего повышения точности теста исследователи добавили к нему новый ген-маркер. На этот раз вместо того, чтобы использовать человеческий ген, они использовали один ген из вируса, HPV16-L1, который также метилировался в человеческих клетках по мере развития рака.

Команда повторила тест с комбинацией четырех генов на новой популяции женщин из Университета Пуэрто-Рико. Рассматривались 115 женщин в возрасте от 21 до 49 лет: у 41 участницы были здоровые ткани шейки матки и у 74 имелся один из трех типов предраковых клеток. При использовании всех четырех генов тест уже имел чувствительность 90,9% и специфичность 60,9%. Затем была выполнена проверка 40 образцов парных тканей шейки матки, крови и мочи из подгруппы пациентов из Пуэрто-Рико. Используя ДНК из крови, ученые обнаружили, что тест имел чувствительность 85,7% и специфичность 60,9%, а при исследовании мочи они обнаружили чувствительность 75% и специфичность 83,3%. Время, необходимое для обработки цервикальных образцов, крови или мочи и получения результата теста, заняло четыре дня, и команда планирует продолжить модификацию теста мочи, чтобы улучшить его чувствительность до аналогичной, получаемой на образцах ткани шейки матки.

Рафаэль Герреро-Престон (Rafael Guerrero-Preston), доктор санитарии и общественной гигиены, магистр общественного здравоохранения, ассистент-профессор и ведущий исследователь, говорит: "Наш анализ мочи будет служить в качестве молекулярной сортировки, иногда дополняющей информацию, полученную с помощью мазка Папаниколау. В развивающихся странах, где нет финансирования, медицинской инфраструктуры или одобрения выполнения мазка Папаниколау, может быть использован наш тест". Исследование было опубликовано 8 ноября 2016 года в журнале Cancer Prevention Research.

Ссылки по теме:
Johns Hopkins School of Medicine
Illumina