We use cookies to understand how you use our site and to improve your experience. This includes personalizing content and advertising. To learn more, click here. By continuing to use our site, you accept our use of cookies. Cookie Policy.

Features Partner Sites Information LinkXpress
Sign In
Advertise with Us
Greiner Bio-One

Download Mobile App




Секвенирование нового поколения выявляет моногенный диабет

By Labmedica International staff writers
Posted on 03 Sep 2019
Print article
Система MiSeq: доступ к специализированным приложениям, таким как целевое ресеквенирование, метагеномика, секвенирование малого генома, целевое профилирование экспрессии генов (фото любезно предоставлено Illumina).
Система MiSeq: доступ к специализированным приложениям, таким как целевое ресеквенирование, метагеномика, секвенирование малого генома, целевое профилирование экспрессии генов (фото любезно предоставлено Illumina).
Моногенный диабет наблюдается главным образом в сахарном диабете взрослого типа у молодых (MODY) и составляет 1-2% всех случаев диабета. У взрослых моногенный диабет трудно отличить от случаев обычного диабета.

Диагностирование моногенного диабета является примером прецизионной медицины, поскольку в том случае передаются специфические особенности в отношении тяжести и течения гипергликемии, риска осложнений диабета, необходимости лечения диабета и его формы, наличия сопутствующих особенностей и лечения больных женщин во время беременности.

Медицинские генетики из больницы Пит-Сальпетриер (Париж, Франция) и их коллеги включили в перекрестное исследование 1564 обследуемых (пробандов), которые были набраны из 116 отделений эндокринологии по всей Франции. Критериями включения были отсутствие аутоантител к диабету и минимум два из трех следующих критериев: возраст ≤ 40 лет и индекс массы тела (ИМТ) <30 кг/кв.м при диагностике у пробанда или по крайней мере у двух родственников с диабетом и семейной историей диабета в 2 и более поколениях.

Генетическое тестирование проводилось в два этапа. Первым было целевое секвенирование нового поколения (СНП), основанное на анализе мультиплексной полимеразной цепной реакции, анализе SureMODY-MASTR. Кодирующие области ± 30 п.н.о. из семи генов (GCK, HNF1A, HNF4A, HNF1B, ABCC8, KCNJ11 и INS) и минимальная область промотора HNF1A, HNF4A и INS были амплифицированы, а мультиплексные библиотеки были впоследствии объединены и запущены на аппарате MiSeq.

Ученые сообщили, что патогенные варианты были выявлены у 254 пациентов (16,2%) и у 23,2% пациентов европеоидной расы. Использование более строгих критериев отбора (семейный анамнез диабета в 3 и более поколениях, возраст при диабете 40 лет и менее и ИМТ <30 кг/кв.м у пробандов, европейское происхождение) увеличило частоту диагностирования до 43%, но 70% идентифицированных случаев были пропущены. GCK (44%), HNF1A (33%) и HNF4A (10%) составляли большинство случаев. Варианты HNF1B (6%), ABCC8/KCNJ11 (4,4%) и INS (2,8%) составили 13% случаев.

По сравнению с немоногенными случаями, более молодой возраст, более низкий ИМТ и отсутствие симптомов диабета при постановке диагноза, европейское происхождение и семейный анамнез диабета в 3 и более поколениях были связаны с моногенным диабетом, но с широким совпадением фенотипов между двумя группами. В общей популяции были выявлены два кластера, которые в основном различались по степени тяжести диабета в начале заболевания. Моногенный диабет был более распространенным в более умеренном фенотипическом кластере. Фенотипы 59 пациентов (3,8%) с вариантами неопределенной значимости отличались от таковых у пациентов с патогенными вариантами, но не от немоногенных пациентов.

Авторы пришли к выводу, что варианты генов HNF1B и АТФ-зависимый калиевый канал чаще участвуют в моногенном диабете, чем сообщалось ранее. Наложение фенотипа затрудняет диагностику моногенного диабета у подростков/взрослых и лежит в основе преимуществ использования СНП у клинически отобранных пациентов. Исследование было опубликовано 11 июля 2019 года в журнале BMC Medicine.

Ссылки по теме:
Pitié-Salpêtrière Hospital


Print article

Channels

Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.