We use cookies to understand how you use our site and to improve your experience. This includes personalizing content and advertising. To learn more, click here. By continuing to use our site, you accept our use of cookies. Cookie Policy.

Features Partner Sites Information LinkXpress
Sign In
Advertise with Us
GLOBETECH PUBLISHING LLC

Download Mobile App




Анализ на основе замыкающего кольцо зонда обнаруживает сезонный грипп и разделяет его на подтипы

By Labmedica International staff writers
Posted on 14 Mar 2019
Print article
Комплекс компонентов анализа на основе замыкающего кольцо зонда для выявления сезонного гриппа (фото любезно предоставлено Стокгольмским университетом).
Комплекс компонентов анализа на основе замыкающего кольцо зонда для выявления сезонного гриппа (фото любезно предоставлено Стокгольмским университетом).
Грипп продолжает оставаться угрозой для всего мира и, по имеющимся оценкам, затрагивает от 5% до 15% населения Земли каждый сезон, вызывая от трех до пяти миллионов тяжелых случаев заболевания и до 500 000 смертельных случаев.

В современной диагностике гриппа преобладают исследования нуклеиновых кислот, которые заменили выделение вирусов и иммунологические анализы по причине высокой чувствительности, специфичности и ускоренного времени выполнения. В продаже имеются несколько коммерческих систем для диагностики гриппа, большинство из которых основано на полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени.

Ученые из Стокгольмского университета (Стокгольм, Швеция) и их коллеги разработали мультиплексный анализ для обнаружения и разделения на подтипы сезонного гриппа на основе замыкающего кольцо зонда (padlock probes) и амплификации по типу катящегося кольца. Команда ученых собрала 65 мазков из носоглотки пациентов в течение сезона 2016 – 2017 годов во время общепринятой диагностики на респираторные вирусные инфекции в Каролинской университетской клинике (Стокгольм, Швеция). Пятнадцать из этих образцов использовались для разработки анализа и пятьдесят образцов использовались для проверки анализа.

Анализ одновременно охватывает все восемь сегментов генома четырех разновидностей циркулирующего гриппа, A(H1N1), A(H3N2), B/Yamagata и B/Victoria, и объединен с прототипом модуля для недорогого количественного определения цифровым методом. Для разработки анализа и его аналитической проверки использовались характерные культуры вируса и мазки из носоглотки пациентов. Выполнение диагностического теста оценивалось слепым методом исследования 50 клинических образцов, проанализированных параллельно с помощью коммерческого анализа на грипп Simplexa Flu A/B & RSV Direct.

Для оптимизации реакций праймеров и зондов продукты амплификации по типу катящегося кольца были определены количественно путем с использованием специализированного инструмента Aquila 400. Команда ученых сообщила, что анализ имел предел обнаружения, равный 18 копий РНК вируса, и достиг 100% аналитической и клинической специфичности для дифференциальной диагностики и выделения подтипов сезонных разновидностей циркулирующего гриппа. Диагностическая чувствительность на 50 клинических образцах составляла 77,5% для обнаружения гриппа и до 73% для выделения подтипов сезонных разновидностей гриппа.

Авторы пришли к заключению, что они разработали анализ на основе замыкающего кольцо зонда, объединенный с недорогим считыванием цифровой информации для обнаружения и выделения подтипов штаммов сезонного гриппа A и B. Продемонстрированная высокая специфичность и возможность мультиплексирования, совместно с цифровой количественной оценкой, доказали, что анализ является многообещающим инструментом для диагностики сезонного гриппа. Исследование было опубликовано в выпуске журнала Clinical Chemistry за декабрь 2018 года.

Ссылки по теме:
Stockholm University
Karolinska University Hospital



Print article

Channels

Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.