We use cookies to understand how you use our site and to improve your experience. This includes personalizing content and advertising. To learn more, click here. By continuing to use our site, you accept our use of cookies. Cookie Policy.

Features Partner Sites Information LinkXpress
Sign In
Advertise with Us
Abbott Diagnostics

Download Mobile App




Белковая подпись влияет на исход при метастатической меланоме

By Labmedica International staff writers
Posted on 04 May 2018
Print article
Времяпролётный масс-спектрометр с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией SimulToF (фото любезно предоставлено Virgin Instruments).
Времяпролётный масс-спектрометр с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией SimulToF (фото любезно предоставлено Virgin Instruments).
Клинические результаты метастатической меланомы при применении антител ниволумаба и пембролизумаба, действующих против PD-1 (белок запрограммированной смерти клетки 1), привели к клинически и статистически значимым улучшениям в беспрогрессивной и общей выживаемости, по сравнению с альтернативными методами терапии первой и второй линии.

Три теста экспрессии лиганда белка запрограммированной смерти клетки 1 (PD-L1) посредством иммуногистохимии одобрены для принятия решений по лечению рака мочевого пузыря и немелкоклеточного рака легкого, а также меланомы с различными анализами с использованием различных порогов скрининга на положительный результат PD-L1, однако в данный момент существует недостаточная стандартизация.

Команда ученых, возглавляемая сотрудниками Центра рака Перлмуттер (Perlmutter Cancer Center; Нью-Йорк, штат Нью-Йорк, США), получила предварительно обработанную сыворотку от 119 отобранных пациентов с меланомой, участвующих в исследовании ниволумаба с мультипептидной вакциной или без нее, и от пациентов, получавших пембролизумаб, ниволумаб, ипилимумаб или вместе ниволумаб и ипилимумаб. Спектры были получены с использованием времяпролётной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF). Эти данные в сочетании с клиническими данными выявили пациентов с лучшими или худшими результатами. Тест был применен к пяти независимым пациентам.

Образцы обрабатывались с использованием стандартизованных рабочих процедур, и команда использовала метод масс-спектрометрии Deep MALDI на масс-спектрометре SimulToF для получения воспроизводимых масс-спектров из небольших количеств сыворотки, показывающих пики из более высокого диапазона распространения, чем это было возможно ранее, путем экспонирования образцов 400 000 импульсами лазера MALDI, по сравнению с несколькими тысячами, используемыми стандартно. Для этого анализа был применен дополнительный независимый справочный набор из 49 образцов сыворотки с данными соответствующей масс-спектрометрии и данными экспрессии белка из панели из 1,129 белков, измеренных SomaLogic.

Ученые обнаружили, что подпись, состоящая из 209 белков или пептидов, была связана с беспрогрессивной и общей выживаемостью в множественном анализе. Производительность тестирования среди проверочных когорт соответствовала результатам разрабатываемого набора. Объединенный анализ, стратифицированный по набору, продемонстрировал значительно лучшую общую выживаемость для "чувствительных" пациентов по отношению к "резистентным". Тест также был связан с выживаемостью в когорте пациентов, получавших ипилимумаб. Обнаружено, что классификация испытаний связана с острофазовыми агентами, комплементами и путями заживления ран.

Доктор философии Хайнрих Родер (Heinrich Roder), главный технический директор Biodesix, сказал: "Адаптация анализа представленности групп генов к данным о белках позволила идентифицировать биологические процессы, связанные с классификациями тестов. Информация, полученная из анализа обогащения белка, может помочь разработать методы лечения, преодолевающие первичную анти-PD-1-резистентность, путем добавления ингибирования активации комплемента, подавления заживления ран или подавления модуляции путей острой фазы методом блокирования IL6 и IL1. Эти данные могут указывать на то, что аналогичные механизмы резистентности могут работать в других типах опухолей и увеличивать вероятность того, что Biodesix сможет разработать тесты не только для меланомы". Исследование было опубликовано 5 декабря 2017 года в журнале Cancer Immunology Research.

Ссылки по теме:
Центра рака Perlmutter


Print article

Channels

Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.