We use cookies to understand how you use our site and to improve your experience. This includes personalizing content and advertising. To learn more, click here. By continuing to use our site, you accept our use of cookies. Cookie Policy.

Features Partner Sites Information LinkXpress
Sign In
Advertise with Us
RANDOX LABORATORIES

Download Mobile App




Секвенирование нового поколения выявляет моногенный диабет

By LabMedica International staff writers
Posted on 03 Sep 2019
Print article
Система MiSeq: доступ к специализированным приложениям, таким как целевое ресеквенирование, метагеномика, секвенирование малого генома, целевое профилирование экспрессии генов (фото любезно предоставлено Illumina).
Система MiSeq: доступ к специализированным приложениям, таким как целевое ресеквенирование, метагеномика, секвенирование малого генома, целевое профилирование экспрессии генов (фото любезно предоставлено Illumina).
Моногенный диабет наблюдается главным образом в сахарном диабете взрослого типа у молодых (MODY) и составляет 1-2% всех случаев диабета. У взрослых моногенный диабет трудно отличить от случаев обычного диабета.

Диагностирование моногенного диабета является примером прецизионной медицины, поскольку в том случае передаются специфические особенности в отношении тяжести и течения гипергликемии, риска осложнений диабета, необходимости лечения диабета и его формы, наличия сопутствующих особенностей и лечения больных женщин во время беременности.

Медицинские генетики из больницы Пит-Сальпетриер (Париж, Франция) и их коллеги включили в перекрестное исследование 1564 обследуемых (пробандов), которые были набраны из 116 отделений эндокринологии по всей Франции. Критериями включения были отсутствие аутоантител к диабету и минимум два из трех следующих критериев: возраст ≤ 40 лет и индекс массы тела (ИМТ) <30 кг/кв.м при диагностике у пробанда или по крайней мере у двух родственников с диабетом и семейной историей диабета в 2 и более поколениях.

Генетическое тестирование проводилось в два этапа. Первым было целевое секвенирование нового поколения (СНП), основанное на анализе мультиплексной полимеразной цепной реакции, анализе SureMODY-MASTR. Кодирующие области ± 30 п.н.о. из семи генов (GCK, HNF1A, HNF4A, HNF1B, ABCC8, KCNJ11 и INS) и минимальная область промотора HNF1A, HNF4A и INS были амплифицированы, а мультиплексные библиотеки были впоследствии объединены и запущены на аппарате MiSeq.

Ученые сообщили, что патогенные варианты были выявлены у 254 пациентов (16,2%) и у 23,2% пациентов европеоидной расы. Использование более строгих критериев отбора (семейный анамнез диабета в 3 и более поколениях, возраст при диабете 40 лет и менее и ИМТ <30 кг/кв.м у пробандов, европейское происхождение) увеличило частоту диагностирования до 43%, но 70% идентифицированных случаев были пропущены. GCK (44%), HNF1A (33%) и HNF4A (10%) составляли большинство случаев. Варианты HNF1B (6%), ABCC8/KCNJ11 (4,4%) и INS (2,8%) составили 13% случаев.

По сравнению с немоногенными случаями, более молодой возраст, более низкий ИМТ и отсутствие симптомов диабета при постановке диагноза, европейское происхождение и семейный анамнез диабета в 3 и более поколениях были связаны с моногенным диабетом, но с широким совпадением фенотипов между двумя группами. В общей популяции были выявлены два кластера, которые в основном различались по степени тяжести диабета в начале заболевания. Моногенный диабет был более распространенным в более умеренном фенотипическом кластере. Фенотипы 59 пациентов (3,8%) с вариантами неопределенной значимости отличались от таковых у пациентов с патогенными вариантами, но не от немоногенных пациентов.

Авторы пришли к выводу, что варианты генов HNF1B и АТФ-зависимый калиевый канал чаще участвуют в моногенном диабете, чем сообщалось ранее. Наложение фенотипа затрудняет диагностику моногенного диабета у подростков/взрослых и лежит в основе преимуществ использования СНП у клинически отобранных пациентов. Исследование было опубликовано 11 июля 2019 года в журнале BMC Medicine.

Ссылки по теме:
Pitié-Salpêtrière Hospital

Platinum Member
COVID-19 Rapid Test
OSOM COVID-19 Antigen Rapid Test
Magnetic Bead Separation Modules
MAG and HEATMAG
Complement 3 (C3) Test
GPP-100 C3 Kit
New
Gold Member
TORCH Panel Rapid Test
Rapid TORCH Panel Test

Print article

Channels

Clinical Chemistry

view channel
Image: The 3D printed miniature ionizer is a key component of a mass spectrometer (Photo courtesy of MIT)

3D Printed Point-Of-Care Mass Spectrometer Outperforms State-Of-The-Art Models

Mass spectrometry is a precise technique for identifying the chemical components of a sample and has significant potential for monitoring chronic illness health states, such as measuring hormone levels... Read more

Hematology

view channel
Image: The CAPILLARYS 3 DBS devices have received U.S. FDA 510(k) clearance (Photo courtesy of Sebia)

Next Generation Instrument Screens for Hemoglobin Disorders in Newborns

Hemoglobinopathies, the most widespread inherited conditions globally, affect about 7% of the population as carriers, with 2.7% of newborns being born with these conditions. The spectrum of clinical manifestations... Read more

Immunology

view channel
Image: A false color scanning election micrograph of lung cancer cells grown in culture (Photo courtesy of Anne Weston)

AI Tool Precisely Matches Cancer Drugs to Patients Using Information from Each Tumor Cell

Current strategies for matching cancer patients with specific treatments often depend on bulk sequencing of tumor DNA and RNA, which provides an average profile from all cells within a tumor sample.... Read more

Microbiology

view channel
Image: Microscope image showing human colorectal cancer tumor with Fusobacterium nucleatum stained in a red-purple color (Photo courtesy of Fred Hutch Cancer Center)

Mouth Bacteria Test Could Predict Colon Cancer Progression

Colon cancer, a relatively common but challenging disease to diagnose, requires confirmation through a colonoscopy or surgery. Recently, there has been a worrying increase in colon cancer rates among younger... Read more

Pathology

view channel
Image: Fingertip blood sample collection on the Babson Handwarmer (Photo courtesy of Babson Diagnostics)

Unique Hand-Warming Technology Supports High-Quality Fingertip Blood Sample Collection

Warming the hand is an effective way to facilitate blood collection from a fingertip, yet off-the-shelf solutions often do not fulfill laboratory requirements. Now, a unique hand-warming technology has... Read more
Copyright © 2000-2024 Globetech Media. All rights reserved.